Titular absoluto do Fluminense desde a chegada do técnico Levir Culpi, o lateral-direito Jonathan atuou por quatro anos no futebol italiano, antes de ir para o Tricolor das Laranjeiras. Em entrevista ao portal GOAL, ele comentou sobre sua passagem pela Inter de Milão, onde nunca conseguiu se firmar com titular indiscutível.
– Foi boa, tive momentos bons na Inter. A adaptação foi difícil, muito por culpa minha pois eu não me empenhava para aprender a língua, e isso foi fundamental para eu ter ido para o Parma (emprestado por seis meses), porque ali tinha muito mais jogadores italianos e isso me obrigava a conversar mais com eles. E na Inter tinha muito brasileiro e eu acabava ficando mais no meio deles. Isso me prejudicou um pouco – disse.