O trabalho do Fluminense com as categorias de base é uma referência no Brasil. Campeão do Campeonato Brasileiro Sub-20 em 2015, o Tricolor é o único clube que avançou para a segunda fase desde o início da competição. Neste ano, foi vice-campeão da Taça BH Sub-17, com a geração que é considerada a mais promissora de Xerém nos últimos anos.
Com orçamento restrito por conta da situação financeira do clube, a base do Fluminense conseguiu superar as dificuldades e soma seis títulos e 11 convocações para a Seleção Brasileira de diversas categorias. O troféu mais recente foi a Copa da Amizade Brasil-Japão sub-15. Em entrevista ao portal “Esporte 24 Horas”, o presidente Pedro Abad destacou cinco nomes que devem figurar nos profissionais.