João Filipe despontou no futebol brasileiro como zagueiro, mas não foi contratado pelo Fluminense para jogar nessa posição. De acordo com o site Globoesporte.com, o defensor vinha atuando no Avaí como volante e será aproveitado desta maneira no Tricolor.
Porém, treinará na zaga para suprir a ausência de jogadores da posição na viagem do Fluminense aos Estados Unidos.