Assim como em 2019, Marcão é novamente treinador do Fluminense na reta final do Brasileirão. No entanto, a situação é completamente diferente. Em 2019, o Tricolor passava aperto e brigava contra o rebaixamento. Oswaldo de Oliveira foi demitido e Marcão assumiu para salvar o Time de Guerreiros da Série B.
Agora, em 2020, a luta é outra. O Fluminense é o quinto colocado, com 39 pontos, e ocupa a 5ª colocação, brigando por uma das vagas na Copa Libertadores de 2021. Marcão assume o posto deixado por Odair Hellmann, que aceitou uma proposta do mundo árabe e encerrou sua passagem pelo Tricolor.