Retornando ao Fluminense, Marquinho foi peça fundamental em 2009, quando o Tricolor escapou do rebaixamento quase certo, dado os 98% de possibilidade disto ocorrer, no Brasileirão daquele ano. Autor do gol tricolor, no empate fora de casa, no Couto Pereira, frente ao Coritiba, o jogador relembra com carinho especial daquela partida.
– Foram tantas as partidas que ficaram marcadas, mas aquela ali não tem como não lembrar. O torcedor, eu, minha família, todo mundo lembro. Quando falei que retornari para o Flumiennse, todo mundo falava daquele gol. Nossa luta foi concretizada naquele gol também. Foi um alívio muito grande para todos nós e isso me fez crescer muito mais e conseguie chegar aonde cheguei – ressaltou.