Jogador que chegou a ficar meio de lado no Fluminense, sem nem sequer ser relacionado em algumas partidas, Nathan não pode mais trocar o Tricolor por nenhum clube da Série A. Isso porque, ao entrar em campo contra o São Paulo, domingo, no Morumbi, pela 17ª rodada do Campeonato Brasileiro, completou sete jogos na competição.
O meia está emprestado ao Fluminense até o fim do ano pelo Atlético-MG. Recentemente, voltou a ser relacionado pelo técnico Fernando Diniz. Na classificação diante do Cruzeiro para as quartas de final da Copa do Brasil, Nathan fez seu primeiro gol pelo Tricolor. Saiu do banco no jogo da volta e marcou o terceiro na vitória por 3 a 0.
Recentemente, chegou a ser especulado como possível alvo do Grêmio. Neste caso, se houvesse um acerto, poderia trocar de clube, pois os gaúchos disputam a Série B. Nathan só não pode mais atuar na Primeira Divisão sem ser pelo Fluminense.