Antes de se tornar treinador, Eduardo Baptista trabalhava com o pai, Nelsinho, como preparador físico. Esteve por um período no futebol japonês. O aprendizado, segundo o comandante do Fluminense, foi ímpar na terra do sol nascente, mas também viveu momentos de tensão. O terremoto no primeiro semestre de 2011 o assustou.